Wykonywanie czynności związanych z obsługą magazynu może być powiązane z rejestracją usług dodatkowych wraz z ewidencją kosztów z tym związanych. Każdy dokument przyjęcia i wydania z magazynu może mieć dopisane dowolne pozycje usług stanowiących wartość dodaną do operacji przyjęcia oraz wydania. Przykładowymi operacjami magazynowymi związanymi z obsługą magazynu wysokiego składowania są czynności związane z przepakowaniem towaru z jednej jednostki logistycznej w inną, oklejanie, foliowanie itp. Każda z tych czynności traktowana jako usługa dodana może być ewidencjonowana nie tylko jako oddzielne zapisy w rejestrze usługa (operacji magazynowych) ale także w powiązaniu z dokumentami przyjęcia do magazynu i wydania z magazynu, a więc bezpośrednio odnoszące się do określonego kontrahenta. Zapisane w ten sposób dane służą do raportowania i zestawiania kosztów usług dodatkowych wraz z możliwością analizy wykorzystania pracy magazynu wynikającej z prac dodatkowych.